Pelaksanaan daftar ulang penerimaan peserta didik MTsN 6 Jombang gelombang satu ini berjalan lancar. Daftar ulang tersebut dilaksanakan pada 4—6 Juni 2020. Calon peserta didik baru membawa beberapa berkas guna melengkapi persyaratan daftar ulang. Sesuai dengan protokol kesehatan, panitia menyiapkan tempat cuci tangan dan tisu. Selain itu , panitia dan calon peserta didik diharuskan menggunakan masker.
Pendaftaran peserta didik baru MTsN 6 Jombang dibuka hingga 30 Juli 2020. Pengumuman akan disampaikan pada 1 Juli 2020.